福建省气象学会在全国省级气象学会和全省各学科学会中争创品牌学会，2013、2014年，均被福建省科协授予“省级学会之星奖”和优秀科技社团“荣誉称号”；2014年被中国气象学会授予2011-2014年度全国省级学会“先进气象学会”，连续多年被中国气象学会授予“优秀学会秘书处”荣誉称号。福建省气象学会充分发挥智囊智库，连续多年参与福建省科协学科发展报告项目研究，积极支持有关科技人员申报科研项目和参与评奖，促进科研成果转化。2019年推荐两项成果分别获得省科技进步奖二等奖、三等奖，4项成果获省气象局科技成果奖。近年，在科普工作方面单位和个人获各类表彰近50项。